巨金鱼战役历时16天，晋冀鲁豫野战军大踏步向敌占区纵深挺进，转战600余里，在连续机动作战中共歼灭国民党正规军3个半旅，加上伪军和保安队共计16000余人，毙伤5500余人。缴获步枪7371支，轻重机枪755挺及大批弹药和军用物资。收复县城9座，迫使已占领濮阳、大名的国民党军回撤，又一次粉碎了国民党军打通平汉路的企图，也支援了华东野战军的鲁南作战。
巨金鱼战役作为一个成功的战例，已载入我军的光荣史册。刘伯承、邓小平从战场实际情况出发，在战役中采取“批亢捣虚”“三变制敌”的战法，充分显示了我军老一辈军事家在作战指挥上坚持实事求是、灵活用兵的鲜明特点和高超的指挥艺术。
1月30日刘邓给军委的报告，总结了巨金鱼战役的经验。关于此次战役的目的，刘邓说：“在宽大机动中大量歼灭敌人，乃坚持主动权。我军在北岸欲消灭王敬久集团未果，形成僵持。而蒋介石正欲以黄河放水隔我于北岸。故我毅然以3、6两纵及7纵1个旅南下收复巨野、嘉祥、城武，进而收复鲁西南，求得主动转变战略态势。”“不管敌人如何攻陷濮（阳）、范（县）、观（城）、大名、南乐，威胁我后方，佯渡黄河逼我回顾，终不能不转用其主力于陇海线，转成被动。”
刘邓指出：“攻敌所必救，消灭其救者；攻敌所必退，消灭其退者，是求得打运动战歼灭敌人的好办法。金乡、鱼台之蒋军嫡系方先觉部，他一被打呼救之声特别急而有效。88师之主力，甚至台湾初到徐州之70师140旅（无作战经验）赶来，张岚峰和刘汝珍也赶来，但先后都被我们各个消灭了。”
战役中不足的是“由于兵员不够充足，及弹药供应量之不足（我火力太弱未能攻下金乡），曾影响到连续作战与战斗解决。战斗进程不够迅速与彻底。这是大军大踏步机动作战的极大苦事，当设法补救之。”（《刘伯承军事文选》）